全自動純淨水灌裝機主要用於源水的淨化，並將處理後的無菌水進行灌裝、封口， 後進行一系列的包裝。灌裝容量一般爲350ml、500ml、1L、1.5L等，只要瓶身直徑相差不大，瓶口尺寸保持一致，灌裝設備則可以通用，只需 換相應撥輪，調整輸送高度即可。
全自動純淨水灌裝機包括水處理設備、吹瓶設備、理瓶機、進瓶風道、三合一灌裝機、上蓋機、瓶蓋消毒機、出瓶輸送、燈檢、吹乾設備、噴碼機、標籤設備、包裝設備。
的運行過程包括以下幾部分：
    水處理部分：源水經抽水泵存入源水箱中，再由高壓泵將源水箱中的水依次通過石英砂過濾器（去除源水中主要大顆粒雜質）、活性炭過濾器（去色、去味）、鈉離子交換器（去除源水金屬成分，軟化水質，防止結垢）、精密過濾器（也稱保安過濾器，去除部分細微顆粒及細菌，主要保護後續的膜設備）、中空纖維過濾器或納濾膜過濾器（礦泉水中含有一定對人體有益的礦物質元素，需將其保留下來，根據礦物質元素大小，選擇中空纖維過濾器或納濾膜過濾器，其目的就是去除不需要的雜質，留下有益的礦物質元素）、 終將過濾好的水送入純水箱，通過臭氧發生器與純水箱連接，使臭氧與純水混合， 終變成無菌成品水。這只是小的水處理系統。
    吹瓶部分：通過吹瓶機，在高壓氣體作用下，將受熱後的瓶胚吹成瓶子。當產量不大時，可選擇人工上瓶。當產量大時，可將吹瓶機與瓶裝水灌裝機通過風道直接連接，但前提是吹瓶機產量要和灌裝設備產量一致。也可以配全自動理瓶機與瓶裝礦泉水灌裝設備直連，白天礦泉水生產完後，晚上吹瓶機加班，滿足次日的生產需求。至於如何配，需要根據廠家實際情況而定。
    灌裝部分：瓶子經風道在風力作用下進入礦泉水灌裝機，依次進行無菌水沖洗、灌裝、封蓋，此三部分集於一個殼體，所以稱之爲三合一灌裝機。在瓶裝礦泉水生產設備中，蓋子殺菌有兩種方案，①配臺瓶蓋消毒櫃，瓶蓋消毒後，由上蓋機將瓶蓋送入理蓋器，經滑到進入封蓋，②配在線式瓶蓋消毒機，首先由上蓋機將瓶蓋送入理蓋器，接着進入在線式消毒機，依次進行消毒水沖洗、無菌水沖洗、風乾， 後通過滑到送入封蓋部分。
    包裝部分：封蓋後的半成品經輸送還需依次進行燈檢（人工肉眼檢測，檢測瓶內是否存在雜質，做 後一道 防線）、吹乾機（吹乾瓶身上的水，便於後續的套標或貼標）、噴碼機（打上生產日期）、標籤機（根據瓶型選擇套標或貼標）、包裝機（可選擇紙箱包裝或膜包裝），產量大時，還可選用碼垛設備，整線全自動化生產。