霍爾果斯經濟開發區實行“一區四園”模式，重點發展化工、農產品深加工、生物制藥、可再生能源、新能源、新材料、建材、進口資源加工、機械制造、商貿物流、旅遊、文化及高新技術等產業。

　　其中，伊寧市重點建設區域性商貿物流中心和優勢資源轉化加工區。主要布局農副產品精深加工、生物化工與生物制藥、機械裝備制造、紡織服裝、新能源、新材料等科技水準領先、附加值高、低能耗低排放無污染的環保型項目，兼有商貿物流、總部經濟、科研培訓、公共服務等功能。

　　霍爾果斯口岸重點建設中哈霍爾果斯國際邊境合作中心中方中心區及配套區。它是中國與哈薩克斯坦等中亞國家開展經濟、文化交流的國際大通道和橋頭堡，融商貿旅遊、進出口貿易和中轉貨物爲一體，對外連接功能齊全、基礎設施較完善，具有全天候進出口能力，並對第三國交通、運輸、旅遊、商貿全方位開放，是與獨聯體中亞五國及歐洲經濟文化交流、擴大對外經濟技術合作的窗口。主要進出口商品種類爲畜產品、石油制品。

　　清水河配套產業園區重點建設農副產品深加工和出口機電產品配套組裝加工基地。園區依託區位、資源、援疆三大優勢，重點發展農副產品深加工、出口產品加工產業。園區已成爲新疆承接東部沿海產業梯度轉移的重要平臺，已形成區域性面向中亞市場的農副產品深加工、輕工紡織、電子包裝、機械建材和進出口產品加工區產業格局。

　　兵團園區因地制宜發展以高端裝備制造、新材料、新能源爲主的新興產業，以總部經濟、現代物流爲主的生產性服務業，適當補充農產品加工業。先後引來了“中國醋王”恆順、央企巨頭中節能、中燁氫能源、天盛國際中心等重量級項目，總投資超百億元。